Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DDX43Q9NXZ2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DDX43Q9NXZ2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DDX43Q9NXZ2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DDX43Q9NXZ2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
DDX43Q9NXZ2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX43Q9NXZ2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX43Q9NXZ2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX43Q9NXZ2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX43Q9NXZ2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX43Q9NXZ2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX43Q9NXZ2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX43Q9NXZ2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX43Q9NXZ2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX43Q9NXZ2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX43Q9NXZ2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX43Q9NXZ2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX43Q9NXZ2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX43Q9NXZ2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX43Q9NXZ2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX43Q9NXZ2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX43Q9NXZ2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX43Q9NXZ2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX43Q9NXZ2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX43Q9NXZ2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX43Q9NXZ2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms