Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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