Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms