Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RLIMQ9NVW2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RLIMQ9NVW2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms