Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATAD3AQ9NVI7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAD3AQ9NVI7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAD3AQ9NVI7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAD3AQ9NVI7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAD3AQ9NVI7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAD3AQ9NVI7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAD3AQ9NVI7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAD3AQ9NVI7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAD3AQ9NVI7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAD3AQ9NVI7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAD3AQ9NVI7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAD3AQ9NVI7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAD3AQ9NVI7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAD3AQ9NVI7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAD3AQ9NVI7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAD3AQ9NVI7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAD3AQ9NVI7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAD3AQ9NVI7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAD3AQ9NVI7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAD3AQ9NVI7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAD3AQ9NVI7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms