Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO28Q9NVF7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms