Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LMBRD1Q9NUN5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms