Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms