Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTPS2Q9NRF8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms