Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHST12Q9NRB3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHST12Q9NRB3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms