Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CENPJQ9HC77 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPJQ9HC77 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms