Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLSPNQ9HAW4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms