Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms