Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf49Q9H6J7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms