Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNMDQ9H2S6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms