Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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LHX5Q9H2C1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LHX5Q9H2C1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LHX5Q9H2C1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LHX5Q9H2C1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LHX5Q9H2C1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LHX5Q9H2C1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LHX5Q9H2C1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LHX5Q9H2C1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX5Q9H2C1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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LHX5Q9H2C1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX5Q9H2C1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX5Q9H2C1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX5Q9H2C1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX5Q9H2C1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX5Q9H2C1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX5Q9H2C1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX5Q9H2C1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX5Q9H2C1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX5Q9H2C1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX5Q9H2C1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX5Q9H2C1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX5Q9H2C1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX5Q9H2C1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX5Q9H2C1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX5Q9H2C1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX5Q9H2C1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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