Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms