Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSER1Q9C0I3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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