Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H9

SRCIN1, SRC kinase signaling inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCIN1Q9C0H9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SRCIN1Q9C0H9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRCIN1Q9C0H9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRCIN1Q9C0H9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRCIN1Q9C0H9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRCIN1Q9C0H9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRCIN1Q9C0H9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRCIN1Q9C0H9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRCIN1Q9C0H9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRCIN1Q9C0H9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRCIN1Q9C0H9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRCIN1Q9C0H9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRCIN1Q9C0H9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRCIN1Q9C0H9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRCIN1Q9C0H9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SRCIN1Q9C0H9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRCIN1Q9C0H9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRCIN1Q9C0H9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRCIN1Q9C0H9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRCIN1Q9C0H9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRCIN1Q9C0H9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRCIN1Q9C0H9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRCIN1Q9C0H9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRCIN1Q9C0H9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRCIN1Q9C0H9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRCIN1Q9C0H9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRCIN1Q9C0H9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRCIN1Q9C0H9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRCIN1Q9C0H9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRCIN1Q9C0H9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRCIN1Q9C0H9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SRCIN1Q9C0H9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRCIN1Q9C0H9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms