Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2OQ9C0C9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms