Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM5Q9C035 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms