Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY65

NPCDR1, Nasopharyngeal carcinoma down-regulated gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPCDR1Q9BY65 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NPCDR1Q9BY65 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPCDR1Q9BY65 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms