Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB2BQ9BVA1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms