Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THUMPD2Q9BTF0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms