Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS4Q9BT78 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS4Q9BT78 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms