Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT17Q9BSW7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT17Q9BSW7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms