Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSU1

C16orf70, UPF0183 protein C16orf70, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf70Q9BSU1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C16orf70Q9BSU1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C16orf70Q9BSU1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms