Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF1Q9BSM1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms