Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms