Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3CQ99985 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3CQ99985 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms