Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5SQ99766 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms