Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3CQ99613 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms