Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD1Q99460 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms