Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R9BQ96SB3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms