Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUDCD1Q96RS6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NUDCD1Q96RS6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms