Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF12Q96QT6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms