Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC74BQ96LY2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms