Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms