Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
VCPIP1Q96JH7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
VCPIP1Q96JH7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VCPIP1Q96JH7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VCPIP1Q96JH7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VCPIP1Q96JH7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VCPIP1Q96JH7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VCPIP1Q96JH7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VCPIP1Q96JH7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VCPIP1Q96JH7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VCPIP1Q96JH7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VCPIP1Q96JH7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VCPIP1Q96JH7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
VCPIP1Q96JH7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VCPIP1Q96JH7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
VCPIP1Q96JH7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VCPIP1Q96JH7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VCPIP1Q96JH7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VCPIP1Q96JH7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VCPIP1Q96JH7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VCPIP1Q96JH7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VCPIP1Q96JH7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VCPIP1Q96JH7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VCPIP1Q96JH7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VCPIP1Q96JH7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VCPIP1Q96JH7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms