Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB6

LOXL4, Lysyl oxidase homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL4Q96JB6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL4Q96JB6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms