Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP36Q96G28 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP36Q96G28 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms