Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms