Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTERF3Q96E29 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms