Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms