Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMARCE1Q969G3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms