Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKD2Q969F2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms