Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C6Q969F1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C6Q969F1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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