Protein–RNA interactions for Protein: Q8WY36

BBX, HMG box transcription factor BBX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBXQ8WY36 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBXQ8WY36 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms