Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms