Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNPDA2Q8TDQ7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNPDA2Q8TDQ7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms